В российской базе данных о мутациях коронавируса хранится более 40 тыс. его вариантов. Регулярное ее пополнение помогает проводить мониторинг эпидемиологической ситуации и отслеживать появление новых геновариантов вируса.

  В Российскую Национальную базу геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2 (VGARus) загружено уже 40383 геномных последовательностей коронавируса, в том числе более 19 тыс. полногеномных последовательностей и свыше 21 тыс. фрагментов генома S-белка. Об этом сообщается на сайте Роспотребнадзора.

  Для сравнения, в международную базу данных GISAID загружено только 9,5 тыс. полных геномов SARS-CoV-2 из России.

  Как пояснил надзорный орган, регулярное пополнение базы данных помогает проводить обширный мониторинг эпидемиологической ситуации в стране, отслеживать появление новых геновариантов коронавируса, контролировать их распространение и делать прогнозы на будущее.

  Кроме того, данные, загруженные российской базой в международную базу GISAID используются для изучения геновариантов, циркулирующих в России, учеными всего мира.

  Также сотрудники Центрального НИИ эпидемиологии разработали алгоритм PARuS для анализа геномных последовательностей SARS-CoV-2, позволяющий производить классификацию вируса по фрагменту S-белка, содержащему информацию о ключевых мутациях, которые, согласно рекомендациям ВОЗ, подлежат специальному мониторингу.

  В июне «МВ» сообщал, что во исполнение Постановления № 448 Правительства в России зарегистрировали Национальную базу данных геномных последовательностей вируса SARS-CoV-2. Разработчиком этой программы и консолидирующим центром стал Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора.

Источник: Медвестник